א נייע וואפן פאר טובערקולאָז דיאַגנאָז און מעדיצין קעגנשטעל דעטעקציע: א נייע דור טאַרגעטעד סיקוואַנסינג (tNGS) קאַמביינד מיט מאַשין לערנען פֿאַר טובערקולאָז היפּערסענסיטיוויטי דיאַגנאָז
ליטעראַטור באַריכט: CCa: אַ דיאַגנאָסטיש מאָדעל באַזירט אויף tNGS און מאַשין לערנען, וואָס איז פּאַסיק פֿאַר מענטשן מיט ווייניקער באַקטיריעל טובערקולאָז און טובערקולאָז מענינגיטיס.
דיסערטאַציע טיטל: טובערקולאָז-געצילטע נעקסט-דור סיקווענסינג און מאַשין לערנען: אַן אולטראַ-סענסיטיוו דיאַגנאָסטיק סטראַטעגיע פֿאַר פּאַוסיפיק פּולמאַנערי טובולאַרס און טובולאַר מענינגיטיס.
צייטשריפט: "Clinica Chimica Acta"
אויב：6.5
דאַטע פון פּובליקאַציע: יאַנואַר 2024
צוזאַמען מיט דער אוניווערסיטעט פון כינעזישער אַקאַדעמיע פון וויסנשאַפֿטן און בעידזשינג טשעסט שפּיטאָל פון קאַפּיטאַל מעדיקאַל אוניווערסיטעט, האָט מאַקראָ און מיקראָ-טעסט אויפגעשטעלט אַ טובערקולאָז דיאַגנאָז מאָדעל באַזירט אויף דער נייער דור פון טאַרגעטעד סיקווענסינג (tNGS) טעכנאָלאָגיע און מאַשין לערנען מעטאָד, וואָס האָט צוגעשטעלט אַולטראַ-הויך דעטעקציע סענסיטיוויטי פֿאַר טובערקולאָז מיט ווייניק באַקטעריע און טובערקולאָז מענינגיטיס, צוגעשטעלט אַ נייע היפּערסענסיטיוויטי דיאַגנאָז מעטאָד פֿאַר דער קלינישער דיאַגנאָז פון צוויי טיפּן טובערקולאָז, און געהאָלפֿן די פּינקטלעכע דיאַגנאָז, מעדיצין קעגנשטעל דעטעקציע און באַהאַנדלונג פון טובערקולאָז. אין דער זעלביקער צייט, איז געפֿונען געוואָרן אַז דער פּאַציענט'ס פּלאַזמע cfDNA קען ווערן גענוצט ווי אַ פּאַסיק מוסטער טיפּ פֿאַר קלינישער סאַמפּלינג אין דער דיאַגנאָז פון TBM.
אין דעם שטודיע, זענען 227 פּלאַזמע סאַמפּאַלז און סערעבראָספּינאַל פליסיק סאַמפּאַלז גענוצט געוואָרן צו גרינדן צוויי קלינישע קאָהאָרטן, אין וועלכע די לאַבאָראַטאָריע דיאַגנאָסטיק קאָהאָרט סאַמפּאַלז זענען גענוצט געוואָרן צו גרינדן דעם מאַשין לערנען מאָדעל פון טובערקולאָז דיאַגנאָז, און די קלינישע דיאַגנאָסטיק קאָהאָרט סאַמפּאַלז זענען גענוצט געוואָרן צו וועריפיצירן דעם געגרינדעטן דיאַגנאָסטיק מאָדעל. אַלע סאַמפּאַלז זענען ערשט געצילט געוואָרן דורך אַ ספּעציעל דיזיינד טאַרגעטעד קאַפּטשער פּראָבע פּול פֿאַר מיקאָבאַקטעריום טובערקולאָז. דערנאָך, באַזירט אויף TB-tNGS סיקוואַנסינג דאַטן, ווערט דער באַשלוס בוים מאָדעל גענוצט צו דורכפירן 5-פאַך קראָס-וואַלידאַציע אויף די טריינינג און וואַלידאַציע סעץ פון די לאַבאָראַטאָריע דיאַגנאָסטיק קיו, און די דיאַגנאָסטיק טרעשאָולדז פון פּלאַזמע סאַמפּאַלז און סערעבראָספּינאַל פליסיק סאַמפּאַלז ווערן באַקומען. דער באַקומענער טרעשאָולד ווערט געבראַכט אין צוויי טעסט סעץ פון קליניש דיאַגנאָז קיו פֿאַר דעטעקציע, און די דיאַגנאָסטיק פאָרשטעלונג פון די לערנער ווערט עוואַלואַטעד דורך ROC קורווע. צום סוף, איז דער דיאַגנאָז מאָדעל פון טובערקולאָז באַקומען געוואָרן.
פיג. 1 סכעמאטישער דיאַגראַם פון פאָרשונג פּלאַן
רעזולטאַטן: לויט די ספּעציפֿישע טרעשאָולדס פון CSF DNA מוסטער (AUC = 0.974) און פּלאַזמע cfDNA מוסטער (AUC = 0.908) באַשטימט אין דעם לערנען, צווישן 227 מוסטערן, איז די סענסיטיוויטי פון CSF מוסטער געווען 97.01%, די ספּעציפֿישקייט איז געווען 95.65%, און די סענסיטיוויטי און ספּעציפֿישקייט פון פּלאַזמע מוסטער זענען געווען 82.61% און 86.36%. אין דער אַנאַליז פון 44 פּאָר מוסטערן פון פּלאַזמע cfDNA און סערעבראָספּינאַל פליסיק DNA פון TBM פּאַציענטן, האט די דיאַגנאָסטישע סטראַטעגיע פון דעם לערנען אַ הויך קאָנסיסטענסי פון 90.91% (40/44) אין פּלאַזמע cfDNA און סערעבראָספּינאַל פליסיק DNA, און די סענסיטיוויטי איז 95.45% (42/44). אין קינדער מיט פּולמאַנערי טובערקולאָז, איז די דיאַגנאָסטישע סטראַטעגיע פון דעם לערנען מער סענסיטיוו צו פּלאַזמע מוסטערן ווי די Xpert דעטעקציע רעזולטאַטן פון מאָגן זאַפט מוסטערן פון די זעלבע פּאַציענטן (28.57% קעגן 15.38%).
פיג. 2 אנאליז פאָרשטעלונג פון טובערקולאָז דיאַגנאָז מאָדעל פֿאַר באַפעלקערונג מוסטערן
