ליטעראַטור טיילן: וויראָמע פּראָפיל פון ווילדע קליינע זויגערס אין מערב אפריקע אַנטפּלעקט נייַע ווירוסן און זאָאָנאָטישע ריסקס

א פרישע שטודיע ארויסגעגעבן איןמיקראָביאָםדורכגעפירט וויראַלע מעטאַגענאָמישע אַנאַליז אויף 846 ווילדע קליינע זויגערס - אַרייַנגערעכנט פלידערמייז, ראָודאַנץ און שראָוז - געזאַמלט אין סיעראַ לעאָנע, מערב אפריקע. די שטודיע האט אידענטיפיצירט אַ גאַנץ פון 39 זויגערס-פֿאַרבונדענע RNA ווירוסן, אַרייַנגערעכנט 26 נייַע און 13 פריער באַקאַנטע ווירוסן. צווישן די, די פּאַראַמיקסאָווירידאַע משפּחה האט אויסגעשטעלט די העכסטע דייווערסיטי, בשעת ראָודאַנץ האָבן געהאַלטן די גרעסטע נומער פון ווירוס מינים (n = 26).

זאָאָנאָטישע ריזיקע אַסעסמענט האָט אַנטפּלעקט דריי באַקאַנטע זאָאָנאָטישע ווירוסן - ענצעפאַלאָמיאָקאַרדיטיס ווירוס, לאַסאַ ווירוס, און ראָקאַהעפּעווירויס ספּ. - ווי אויך דריי ווירוסן מיט פּאָטענציעלן שפּילאָוווער ריזיקע: מעליאַן ווירוס, ראָודאַנט העפּאַטיטיס ווירוס, און הוניווירוס A. באַמערקענסווערט, צווישן די ניי אידענטיפיצירטע ווירוסן, האָט באַט לעדאַנטעווירויס 2 געוויזן די נאָענטסטע פילאָגענעטישע באַציִונג צום מענטש-אינפעקטירנדיקן לע דאַנטעק ווירוס. סעראָלאָגישע אַנאַליז האָט ווייטער דעטעקטירט נויטראַליזירנדיקע אַנטיקערפּערס קעגן דעם ווירוס אין 2.8% פון לאָקאַלע איינוואוינער, וואָס סאַגדזשעסטירט פריערדיקע, מסתּמא נישט-דעטעקטירטע, מענטשלעכע אויסשטעלונג.

די רעזולטאַטן אונטערשטרייַכן די אנוועזנהייט פון אַ באַטייטיק ראָודאַנט-דאָמינירט ווירוס רעזערוווואַר אין מערב אפריקע און אונטערשטרייכן די קריטישע וויכטיקייט פון אינטעגרירטע אויפזיכט סטראַטעגיעס ביים מענטש-חיה אינטערפאַס. קאַמביינינג מעטאַגענאָמיק סקרינינג מיט סעראָלאָגישער וואַלידאַציע גיט אַ שטאַרקע פריימווערק פֿאַר אידענטיפיצירן ווירוסן מיט זאָאָנאָטיש און ספּילאָוווער פּאָטענציעל.

איבער די לעצטע צען יאר, מער ווי 60% פון אויפקומענדיקע אנשטעקנדיקע קראנקהייטן אין מענטשן שטאמען פון כייַע רעזערוווואַרן, מיט פלידערמייז, נאַגערס און שראָוז אנערקענט ווי שליסל באַלעבאָטים פון זאָאָנאָטישע ווירוסן. אפריקע איז ברייט באַטראַכט ווי אַ הייס אָרט פֿאַר זאָאָנאָטישע קראנקהייטן. למשל, סיערע לעאָנע האט געמאלדן איבער 28,000 קאַסעס בעשאַס די 2014-2016 עבאָלאַ אויסברוך.

טראָץ דעם באַדייטנדיקן לאַסט פון זאָאָנאָטישע קראַנקייטן אין דעם ראַיאָן, בלייבן די דייווערסיטי און פאַרשפּרייטונג פון ווירוסן אין ווילדע קליינע זויגערס נישט גענוג כאַראַקטעריזירט. כּדי צו פֿאַרריכטן דעם חסרון, האָבן די פֿאָרשער דורכגעפֿירט אַ סיסטעמאַטישע וויראָם אַנאַליז פון 846 ווילדע קליינע זויגערס געכאפט אין דריי ערטער אין סיערע לעאָנע צווישן 2018 און 2023. די שטודיע האָט געצילט צו כאַראַקטעריזירן וויראַלע דייווערסיטי, ידענטיפֿיצירן קאַנדידאַטן מיט קראָס-ספּעציעס טראַנסמיסיע פּאָטענציעל, אָפּשאַצן זאָאָנאָטיש ריזיקירן, און דזשענערירן באַווייַזן צו שטיצן פרי וואָרענונג סיסטעמען פֿאַר אויפֿקומענדיקע ינפעקטיאָוס קראַנקייטן.

קאָר מעטאָדן

די שטודיע האָט אָנגעווענדט אַן אַלגעמיינעם וויראַלן מעטאַגענאָמיקס וואָרקפלאָו:

• מוסטער פּראַסעסינג:האַרץ, לעבער, מילץ, לונג, און ניר געוועבן זענען געזאַמלט געוואָרן, צוזאַמענגעשטעלט, כאָומאַדזשענייזד, און אונטערגעוואָרפן צו גאַנץ רנאַ עקסטראַקציע.
• סיקווענסינג און אַסעמבלי:ריבאָסאָמאַל RNA דיפּלישאַן איז דורכגעפירט געוואָרן איידער די ביבליאָטעק קאַנסטרוקציע, נאכגעפאָלגט דורך הויך-דורכפיר סיקווענסינג ניצן די Illumina NovaSeq 6000 פּלאַטפאָרמע. וויראַל קאָנטיגס זענען צוזאַמענגעשטעלט געוואָרן דע נאָוואָ.
• ווירוס אידענטיפיקאציע:ווירוסן זענען אידענטיפיצירט געוואָרן באַזירט אויף RNA-אָפּהענגיקער RNA פּאָלימעראַזע (RdRp) גען אויסלייג. נאָר ווערטעבראַט-פֿאַרבונדענע ווירוסן זענען איבערגעהאַלטן געוואָרן, אַחוץ באַקטיריעלע, פונגאַל און פלאַנצן ווירוסן.
• ביאָאינפאָרמאַטיק אַנאַליז:פילאָגענעטישע רעקאָנסטרוקציע, רעקאָמבינאַציע אַנאַליז, קראָס-ספּעציעס טראַנסמיסיע נעץ מאָדעלינג, און זאָאָנאָטישע ריזיקאָ אַסעסמאַנט זענען דורכגעפירט געוואָרן.
• סעראָלאָגישע וואַלידאַציע:א VSV-באזירטער פּסעוודאָווירוס נויטראַליזאַציע אַסיי איז דעוועלאָפּעד געוואָרן פֿאַר באַט לעדאַנטעווירוס 2. נויטראַליזירנדיקע אַנטיקערפּערס זענען דעטעקטירט געוואָרן אין 2.8% פון מענטשלעכע סערע, וואָס גיט באַווייַז פון פּאָטענציעלער זאָאָנאָטישער טראַנסמיסיע.
  

  שטודירןרעזולטאַטן

  1. וויראַלע אויפדעקונג און דייווערסיטי

  די שטודיע האט דורכגעפירט טראַנסקריפּטאָמישע סיקווענסינג אַנאַליז אויף 846 ווילדע חיות געזאמלט אין סיעראַ לעאָנע, אַרייַנגערעכנט ראָודאַנץ, פלידערמייז און שראָוז. באַזירט אויף פולשטענדיקע RNA-אָפּהענגיקע RNA פּאָלימעראַזע (RdRp) גען סיקוואַנסן, זענען אַ סך הכל פון 39 זויגער-פֿאַרבונדענע RNA ווירוסן אידענטיפֿיצירט געוואָרן, אַרייַנגערעכנט 13 פריער באַקאַנטע ווירוסן און 26 נייַע ווירוסן.

  אין טערמינען פון וויראַל צוזאַמענשטעל, האָט די פּאַראַמיקסאָווירידאַע משפּחה אויסגעוויזן די העכסטע מדרגה פון דייווערסיטי אַריבער אַלע דריי באַלעבאָס אָרדערס, נאכגעפאָלגט דורך אַסטראָווירידאַע און פּיקאָרנאַווירידאַע. וועגן באַלעבאָס פאַרשפּרייטונג, האָבן ראָודאַנץ בייגעטראָגן די גרעסטע וויראַל דייווערסיטי, וואָס האָבן געהאַלטן אַ גאַנץ פון 26 ווירוס מינים, וואָס ווייַזט אויף זייער פּראָמינענט ראָלע ווי רעזערוווואַרן פון וויראַל דייווערסיטי אין דער געגנט.

  2. זאָאָנאָטיש ריזיקע

  זאָאָנאָטישע ריזיקע אַסעסמענט האָט אידענטיפיצירט דריי באַקאַנטע זאָאָנאָטישע ווירוסן: ענצעפאַלאָמיאָקאַרדיטיס ווירוס, לאַסאַ ווירוס, און ראָקאַהעפּעווירויס מינים. דערצו, דריי ווירוסן—מעליאַן ווירוס, ראָודאַנט העפּאַטיטיס ווירוס, און הוניווירוס א—זענען אידענטיפיצירט געוואָרן ווי מיט פּאָטענציעלן שפּיל-איבער ריזיקע.

  צווישן די 26 ניי-אנטדעקטע ווירוסן, זענען פיר פאראויסגעזאגט געווארן צו פארמאגן הויכע זאאנאטישע פאטענציאל באזירט אויף פילאגענעטישע און גענאמישע אייגנשאפטן. באמערקענסווערט, האט פלעטערמויז לעדאנטעווירוס 2 געוויזן די נענטסטע פילאגענעטישע באציאונג צום באקאנטן מענטש-אינפעקטירנדיקן לע דאנטעק ווירוס.

  שפּעטערדיקע סעראָלאָגישע אויספאָרשונג האָט ווייטער געשטיצט דעם געפינס, ווײַל נויטראַליזירנדיקע אַנטיקערפּערס קעגן באַט לעדאַנטעווירוס 2 זענען דעטעקטירט געוואָרן אין 2.8% פון סערע פון ​​לאָקאַלע איינוואוינער. דאָס רעזולטאַט פֿאָרשלאָגט אַז נישט-דערקענטע אָדער אַסימפּטאָמאַטישע אינפעקציעס זענען אפשר שוין פֿאָרגעקומען אין דער מענטשלעכער באַפֿעלקערונג, וואָס אונטערשטרייכט אַ פּאָטענציעלן אָבער פריער נישט-דעטעקטירטן זאָאָנאָטישן טראַנסמיסיע וועג.

  3. קראָס-ספּעציעס טראַנסמיסיע דינאַמיק

  קראָס-ספּעציעס טראַנסמיסיע אַנאַליז האט געוויזן אַז ראָודאַנץ פאַרנעמען אַ צענטראַלע פּאָזיציע אין די ווירוס טיילן נעץ, אַקטינג ווי שליסל נאָודז וואָס פאַסילאַטייט ווירוס וועקסל צווישן באַלעבאָס מינים. א גאַנץ פון 15 ווירוסן זענען יידענטאַפייד ווי מיט די פּאָטענציעל פֿאַר קראָס-ספּעציעס טראַנסמיסיע.

  ווייטערדיגע אנאליזן פון קראָס-אָרדער טראַנסמיסיע פּאַטערנז האָבן געוויזן אַז ווירוס טיילן איז געווען מער אָפט צווישן באַלעבאָטים אין דער זעלביקער טאַקסאָנאָמישער סדר, וואָס סאַגדזשעסט אַז באַלעבאָט פֿאַרבינדונג שפּילט אַ וויכטיקע ראָלע אין טראַנסמיסיע דינאַמיק. אין קאַנטראַסט, פלידערמייז האָבן געוויזן אַ רעלאַטיוו נידעריקער קאַפּאַציטעט פֿאַר קראָס-אָרדער טראַנסמיסיע.

  וויכטיג, באווייזן פון באַלעבאָס קייט יקספּאַנשאַן איז באמערקט אין זיכער ווירוסן. למשל, מעליאַן ווירוס, וואָס איז פריער געווען געהאלטן ספּעציפיש צו שראָוז, איז אויך דיטעקטעד אין ראָודאַנץ אין דעם לערנען, וואָס ינדיקייץ אַ פּאָטענציעל ענדערונג אין באַלעבאָס אַדאַפּטאַבילאַטי און אַ געוואקסן ריזיקירן פון ברייטער טראַנסמיסיע.

  

  מסקנות און עפנטלעכע געזונטהייט אימפליקאציעס

  • הויכע וויראָם דייווערסיטי אין ווילדע קליינע זויגערס:די ענטדעקונג פון 39 RNA ווירוסן, אריינגערעכנט 26 נייע מינים, אַנטפּלעקט אַ גרויסן ווירוס רעזערוווואַר אין דער געגנט און באַריכטעט צום ערשטן מאָל נייע ווירוסן מיט הויכן זאָאָנאָטישן פּאָטענציאַל (למשל, פלעטערמויז לעדאַנטעווירוס 2).
  • ראָודאַנץ ווי פּריאָריטעט אויפֿזיכט צילן:ראָודאַנץ אַקט ווי שליסל כאַבז פֿאַר ווירוס טראַנסמיסיע און טראָגן די העכסטע ווירוס דייווערסיטי, רעפּרעזענטירנדיק די גרעסטע ספּילאָוווער ריזיקירן.
  • נויט פֿאַר אינטעגרירטע אויפֿזיכט סטראַטעגיעס:די רעזולטאַטן שטיצן דאָס געבן אַ פּרייאָריטעט צו ראָודאַנץ אין אַקטיווע אויפֿזיכט פּראָגראַמען און דורכפֿירן אינטעגרירטע צוגאַנגען וואָס קאָמבינירן מעטאַגענאָמיקס, סעראָלאָגיע און עקאָלאָגישע מאָניטאָרינג ביי מענטש-ווילדע חיות אינטערפֿייסיז.

  אינגאנצן, די שטודיע גיט קריטישע באווייזן צו שטיצן פריע ווארענונג סיסטעמען און ריזיקע אפשאצונג פריימווערקס פאר אויפקומענדיקע זאאנאטישע קראנקהייטן, פארשטארקנדיק די וויכטיקייט פון פראאקטיווע אויפזיכט אין הויך-ריזיקירטע געגנטן.

  פּראָדוקט אינפֿאָרמאַציע